Laut Spezifikation benötigt der VIA EDEN Prozessor des EPIA-CL6000 Mainboards keine aktive Kühlung. Allerdings wird der Kühlkörper bei hoher CPU-Auslastung sehr heiss. Die Senkung der Temperatur des Kühlkörpers mittels einer aktiven Kühllösung hat sich als sehr effektiv erwiesen. Schon bei niedriger Lüfterdrehzahl kann die Betriebstemperatur der Komponenten drastisch gesenkt werden. Typischerweise erzielt ein größerer Lüfter einen besseren Kühleffekt bei sogar niedrigerem Geräuschpegel als ein kleinerer Lüfter. Deshalb kann mit dem derzeit verwendeten 120x120x25 mm Lüfter ein noch leiserer Betrieb bei noch niedriger Drehzahl gewährleistet werden als mit dem ursprünglich verwendeten 40x40x10 mm Lüfter, welcher auf dem oberen Foto zu sehen ist. Die vier Schaumstoffpads, auf denen der neue Lüfter gelagert ist, verhindern effektiv die Übertragung von Vibrationen auf das Gehäuse. Der Kühlkörper wird selbst bei hoher CPU-Auslastung gerade mal handwarm und das Betriebsgeräusch ist im Abstand von einem Meter kaum noch wahrnehmbar.
